他是能彈琴又能製琴的全能古琴家，屬於國寶級 民族藝師，對古琴音樂藝術發展的影響深遠。 他將幾近絕傳的製琴工藝留承下來。為了研究造琴， 孫毓 芹花了很大心血，對於古書上所述的造琴法仔細分析， 並且試驗和改進，有時為了造琴的特殊需求，還會自己發明一些工具來因應。 無師自通由不懂到成為專家，從不斷試驗中累積經驗，由新手變成好手， 成了能彈琴又能製琴的全能古琴家，間接地促及了古琴音樂藝術的發展。
孫毓芹受到家學淵源的影響，少年時即喜好文藝、音樂、繪畫、藝術及武術，但直到十五歲後，才有正式學習古琴的機會，起初是孫毓芹的表弟在學堂裡向田疇學習，知情後孫毓芹也想嘗試，兩人共同學琴，沒想到孫毓芹後來居上，最後更勝一籌獲得啟蒙老師-田疇的喜愛。學琴三年的時間對孫毓芹來說不算長，但是對於他個人的氣質、性格卻起了相當大的影響。
孫毓芹後來投身軍旅，輾轉來到臺灣，再度重拾因軍旅生涯而擱置的古琴演奏，此時的他因緣際會下認識了知名古琴家章志蓀並拜師於其下。章志蓀初見他時充滿懷疑，認為一介武夫難以參透古琴的優美雅致，不是非常願意收這個學生，沒想到他最後不但得到老師的讚賞，也繼承了古琴大師的衣缽。孫毓芹在一九八五年和一九八九年前後獲頒『薪傳獎』及當選『國寶級民族藝師』。當時文章標題用了『淡泊名利，只好（ㄏㄠˋ）彈琴』來推崇他的豐功偉業，但孫毓芹本人卻自我解嘲為『淡泊名利，只好（ㄏㄠˇ）彈琴』。